RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491749.2

EFHC1-204, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-204	ENST00000491749	APBA3	O96018	575 aa		33.72	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.72	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.7	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
EFHC1-204	ENST00000491749	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.69	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.67	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.67	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.66	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.66	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	RREB1	Q92766	1687 aa		33.65	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.65	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	IL13	P35225	146 aa		33.65	■■■□□ 2.98
EFHC1-204	ENST00000491749	BTAF1	O14981	1849 aa		33.63	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.63	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.61	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	KCNQ2	O43526	872 aa		33.6	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.59	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	KDR	P35968	1356 aa		33.59	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EFHC1-204	ENST00000491749	PLSCR1	O15162	318 aa		33.57	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	CYP27B1	O15528	508 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.53	■■■□□ 2.96
EFHC1-204	ENST00000491749	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	ITGB4	P16144	1822 aa		33.5	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.48	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.48	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	PHKG2	P15735	406 aa		33.46	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	HMOX1	P09601	288 aa		33.45	■■■□□ 2.95
EFHC1-204	ENST00000491749	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	RALBP1	Q15311	655 aa		33.44	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.42	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	LY75	O60449	1722 aa		33.42	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	PROM2	Q8N271	834 aa		33.4	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.4	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
EFHC1-204	ENST00000491749	NBPF14	Q5TI25	921 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.37	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.36	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.35	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.34	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.33	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
EFHC1-204	ENST00000491749	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.31	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.3	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	PIGB	Q92521	554 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.28	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.26	■■■□□ 2.92
EFHC1-204	ENST00000491749	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.26	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.25	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.25	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.24	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	FCHSD2	O94868	740 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	C5	P01031	1676 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.22	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.22	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	CABP4	P57796	275 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EFHC1-204	ENST00000491749	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	MRC1	P22897	1456 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	KCNQ4	P56696	695 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.17	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.17	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	LRP5	O75197	1615 aa		33.17	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.16	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.14	■■■□□ 2.9
EFHC1-204	ENST00000491749	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms