RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.03■□□□□ 0.96
SOGA3-206ENST00000474293 HTRA3P83110 453 aa21.02■□□□□ 0.96
SOGA3-206ENST00000474293 TOMM70O94826 608 aa21.01■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 TNS4Q8IZW8 715 aa21.01■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 NSD2O96028 1365 aa21■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.99■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 EVC2Q86UK5 1308 aa20.99■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 PRELPP51888 382 aa20.98■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 KLRG1Q96E93 195 aa20.96■□□□□ 0.95
SOGA3-206ENST00000474293 NME9Q86XW9 330 aa20.95■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.95■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 LY75O60449 1722 aa20.94■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.94■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 USP47Q96K76 1375 aa20.94■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 SMIM5Q71RC9 77 aa20.93■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 JMYQ8N9B5 988 aa20.92■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.92■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 USP31Q70CQ4 1352 aa20.9■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.9■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.9■□□□□ 0.94
SOGA3-206ENST00000474293 PHF14O94880 888 aa20.89■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 WDR90Q96KV7 1748 aa20.87■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 LTN1O94822 1766 aa20.86■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 IP6K1Q92551 441 aa20.85■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 AK7Q96M32 723 aa20.85■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.84■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 BCS1LQ9Y276 419 aa20.84■□□□□ 0.93
SOGA3-206ENST00000474293 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 C5P01031 1676 aa20.82■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 PALLDQ8WX93 1383 aa20.82■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.82■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 MEGF6O75095 1541 aa20.81■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.8■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 A0A0G2JLW4 131 aa20.79■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 FSTL1Q12841 308 aa20.79■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 TMC1Q8TDI8 760 aa20.79■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.78■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 USP54Q70EL1 1684 aa20.77■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 FBLN1P23142 703 aa20.77■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.77■□□□□ 0.92
SOGA3-206ENST00000474293 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.76■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.76■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.75■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 MMP10P09238 476 aa20.75■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 HOXC9P31274 260 aa20.75■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 C4BP0C0L5 1744 aa20.75■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 FCHSD2O94868 740 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 SLC34A2O95436 690 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 AMPHP49418 695 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 RRAGCQ9HB90 399 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.74■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 SSFA2P28290 1259 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 TGFB2P61812 414 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 NBPF4Q96M43 638 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.72■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 DPEP1P16444 411 aa20.71■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.71■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.71■□□□□ 0.91
SOGA3-206ENST00000474293 GNPATO15228 680 aa20.7■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.69■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.69■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.68■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.68■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.68■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 PIGBQ92521 554 aa20.67■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.67■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.67■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.67■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 RNF181Q9P0P0 153 aa20.66■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.66■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.66■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 A0A1W2PP64 1363 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 CYP27B1O15528 508 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 SIK1P57059 783 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 ITPK1Q13572 414 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 COG3Q96JB2 828 aa20.65■□□□□ 0.9
SOGA3-206ENST00000474293 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms