RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	SLIT3	O75094	1523 aa		11.74	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	SLIT2	O94813	1529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	MYOM1	P52179	1685 aa		11.74	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	USP19	O94966	1318 aa		11.73	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	NUDT7	P0C024	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		11.73	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.72	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	ABCC6	O95255	1503 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	AFF2	P51816	1311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.71	□□□□□ -0.53
USP34-208	ENST00000467128	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128		A0A1W2PP64	1363 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	CPD	O75976	1380 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ATRN	O75882	1429 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	NLRP13	Q86W25	1043 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	NFAT5	O94916	1531 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.67	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	USP21	Q9UK80	565 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	SLC34A2	O95436	690 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP34-208	ENST00000467128	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.65	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	GLI3	P10071	1580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	COL18A1	P39060	1754 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	GC	P02774	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	RXRB	P28702	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	RGS12	O14924	1447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	LTN1	O94822	1766 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	VPS72	Q15906	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.62	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	SOCS7	O14512	581 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		11.61	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	PTGER2	P43116	358 aa		11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.6	□□□□□ -0.55
USP34-208	ENST00000467128	NSD2	O96028	1365 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	NME9	Q86XW9	330 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.58	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	CRB1	P82279	1406 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	EP400	Q96L91	3159 aa		11.57	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	PBX2	P40425	430 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	COG3	Q96JB2	828 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		11.56	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.56	□□□□□ -0.56

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