RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 MYT1Q01538 1121 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 SIX5Q8N196 739 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-205ENST00000462042 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH1A1P00352 501 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 CLDN10P78369 228 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PSME1Q06323 249 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP4X1Q8N118 509 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 GDF9O60383 454 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 DPYDQ12882 1025 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC102BQ68D86 513 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 BRD1O95696 1058 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC13P55735 322 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR20EP86478 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR20CP86479 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR20DP86480 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR20BP86481 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR20AP86496 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 NNTQ13423 1086 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 SCTRP47872 440 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 STK32AQ8WU08 396 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 CYLDQ9NQC7 956 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R2N6 131 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 NR3C2P08235 984 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-205ENST00000462042 LILRA1O75019 489 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1024Q9UPX6 916 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 DKK1O94907 266 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 GNRH1P01148 92 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF10AO00220 468 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 BACH1O14867 736 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNA1Q09470 495 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 J3QL48 77 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 ADH1AP07327 375 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 GDF10P55107 478 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGGTB-205ENST00000462042 SFI1A8K8P3 1242 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SMPD1P17405 629 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZVU0 165 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 INHAP05111 366 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ITPKCQ96DU7 683 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 HINFPQ9BQA5 517 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF358Q9NW07 568 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 CARNS1A5YM72 827 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SCNN1DP51172 638 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMP2P16035 220 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP2B4P23634 1241 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SSFA2P28290 1259 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 XAGE2Q96GT9 111 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 MTMR7Q9Y216 660 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 PTGIRP43119 386 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-205ENST00000462042 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CBLBQ13191 982 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CLN3Q13286 438 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-205ENST00000462042 MEIOBQ8N635 442 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms