RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461181.1

TTLL4-213, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, human

TSL 4

Gene TTLL4, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL4-213	ENST00000461181	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	MCM10	Q7L590	875 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	GNAI1	P63096	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	MEGF6	O75095	1541 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	HSPA1L	P34931	641 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	CRB1	P82279	1406 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	NEFL	P07196	543 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL4-213	ENST00000461181	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	CHL1	O00533	1208 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	IL2RB	P14784	551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	FKBP8	Q14318	412 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	PHKG2	P15735	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	SLIT2	O94813	1529 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	LRP6	O75581	1613 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	CYP27B1	O15528	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	BCAR3	O75815	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	PLIN1	O60240	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	VAMP4	O75379	141 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	TEF	Q10587	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL4-213	ENST00000461181	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	VPS72	Q15906	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL4-213	ENST00000461181	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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