RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CERS1-201ENST00000429504 RGS12O14924 1447 aa34.75■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 LRRC37A3O60309 1634 aa34.75■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 LNPKQ9C0E8 428 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 KRT24Q2M2I5 525 aa34.73■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 SIRT2Q8IXJ6 389 aa34.72■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 PTPRCP08575 1304 aa34.72■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 NFKBIBQ15653 356 aa34.72■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 NWD1Q149M9 1564 aa34.71■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 HOXC9P31274 260 aa34.7■■■■□ 3.15
CERS1-201ENST00000429504 FOXO3O43524 673 aa34.69■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 LTN1O94822 1766 aa34.69■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 ABTB2Q8N961 1025 aa34.68■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 RTL1A6NKG5 1358 aa34.68■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 BMP2KLQ5H9B9 411 aa34.67■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD45Q5TZF3 282 aa34.67■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.66■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 C22orf23Q9BZE7 217 aa34.65■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 TSPYL4Q9UJ04 414 aa34.64■■■■□ 3.14
CERS1-201ENST00000429504 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.63■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.62■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 CACNA1FO60840 1977 aa34.62■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 ATP10DQ9P241 1426 aa34.61■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 MIS18AQ9NYP9 233 aa34.59■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 MSH6P52701 1360 aa34.59■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 NFAT5O94916 1531 aa34.58■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D2Q9BYX2 928 aa34.58■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 GNAT3A8MTJ3 354 aa34.58■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 SLC4A2P04920 1241 aa34.58■■■■□ 3.13
CERS1-201ENST00000429504 DCTPP1Q9H773 170 aa34.57■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.56■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K5Q99683 1374 aa34.56■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 BABAM1Q9NWV8 329 aa34.52■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 RBM25P49756 843 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 ANTXR1Q9H6X2 564 aa34.51■■■■□ 3.12
CERS1-201ENST00000429504 C14orf37Q86TY3 774 aa34.51■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 CEP85Q6P2H3 762 aa34.5■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 IP6K1Q92551 441 aa34.5■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 CCT4P50991 539 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 MEIS3Q99687 375 aa34.46■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 STK31Q9BXU1 1019 aa34.46■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 G2E3Q7L622 706 aa34.45■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 IL17REQ8NFR9 667 aa34.45■■■■□ 3.11
CERS1-201ENST00000429504 PSME1Q06323 249 aa34.45■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.45■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.45■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.43■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa34.43■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa34.41■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.4■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.39■■■■□ 3.1
CERS1-201ENST00000429504 HMMRO75330 724 aa34.38■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 CDC45O75419 566 aa34.38■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.38■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 SLIT3O75094 1523 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 F6X3S4 739 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 GSE1Q14687 1217 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 FLIIQ13045 1269 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 SLC4A10Q6U841 1118 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 TTC22Q5TAA0 569 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 HSCBQ8IWL3 235 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 SNX21Q969T3 373 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 PXDNLA1KZ92 1463 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 NBPF4Q96M43 638 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.35■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CERS1-201ENST00000429504 KIF1AQ12756 1690 aa34.31■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.31■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 NCAPD2Q15021 1401 aa34.31■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.3■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 GNAI2P04899 355 aa34.3■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 BCL11AQ9H165 835 aa34.29■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 ORAI2Q96SN7 254 aa34.28■■■■□ 3.08
CERS1-201ENST00000429504 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms