RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429031.5

PSRC1-208, Transcript of proline and serine rich coiled-coil 1, human

TSL 3

Gene PSRC1, Length 835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSRC1-208	ENST00000429031	APBA3	O96018	575 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	IL13	P35225	146 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	KCNQ2	O43526	872 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PSRC1-208	ENST00000429031	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	NHS	Q6T4R5	1651 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	PPP2R1A	P30153	589 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	CYP27B1	O15528	508 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSRC1-208	ENST00000429031	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	29.19	■■■□□ 2.26	5e-6	■■■■□ 22.9
PSRC1-208	ENST00000429031	SPG7	Q9UQ90	795 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	KDR	P35968	1356 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	PLSCR1	O15162	318 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	BTAF1	O14981	1849 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	RREB1	Q92766	1687 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSRC1-208	ENST00000429031	HMOX1	P09601	288 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	PROM2	Q8N271	834 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	PHKG2	P15735	406 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	CFAP53	Q96M91	514 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
PSRC1-208	ENST00000429031	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	RALBP1	Q15311	655 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	TXNRD1	Q16881	649 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	ITGB4	P16144	1822 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PSRC1-208	ENST00000429031	NUDC	Q9Y266	331 aa		29	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	PIGB	Q92521	554 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	LY75	O60449	1722 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PSRC1-208	ENST00000429031	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	KCNQ4	P56696	695 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	PAPPA	Q13219	1627 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	FCHSD2	O94868	740 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PSRC1-208	ENST00000429031	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	CABP4	P57796	275 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	SLC15A2	Q16348	729 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	STK32B	Q9NY57	414 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	ZNF827	Q17R98	1081 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PSRC1-208	ENST00000429031	AKT1S1	Q96B36	256 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PSRC1-208	ENST00000429031	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PSRC1-208	ENST00000429031	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PSRC1-208	ENST00000429031	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PSRC1-208	ENST00000429031	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.8	■■■□□ 2.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms