RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-202ENST00000428394 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-202ENST00000428394 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-202ENST00000428394 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.83■□□□□ 0.93
HCLS1-202ENST00000428394 CHL1O00533 1208 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 TNRQ92752 1358 aa20.82■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 NME9Q86XW9 330 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 RTL1A6NKG5 1358 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 USP31Q70CQ4 1352 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 HMMRO75330 724 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 REC8O95072 547 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 CACNA1FO60840 1977 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 METP08581 1390 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 ST18O60284 1047 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 USP26Q9BXU7 913 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CEP85Q6P2H3 762 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 MCM2P49736 904 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 PANK2Q9BZ23 570 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC37A3O60309 1634 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 ESPNB1AK53 854 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF445P59923 1031 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CRB1P82279 1406 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 HS1BP3Q53T59 392 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 SSH2Q76I76 1423 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.73■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 USP6P35125 1406 aa20.73■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.73■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.73■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 USP54Q70EL1 1684 aa20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 PEAK1Q9H792 1746 aa20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 MSH6P52701 1360 aa20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 IL17RAQ96F46 866 aa20.72■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 KDRP35968 1356 aa20.71■□□□□ 0.91
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.7■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRUQ92729 1446 aa20.7■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.7■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ERC2O15083 957 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SSFA2P28290 1259 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ANAPC15P60006 121 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 AOX1Q06278 1338 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SDSP20132 328 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL34Q8N239 644 aa20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.67■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SBNO1A3KN83 1393 aa20.67■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.67■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 FAM83GA6ND36 823 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 FBLN1P23142 703 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 FLT4P35916 1363 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 DIP2AQ14689 1571 aa20.66■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 MCCP23508 829 aa20.65■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.65■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 GNAI3P08754 354 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 TERF1P54274 439 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.64■□□□□ 0.9
HCLS1-202ENST00000428394 TPM2P07951 284 aa20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.63■□□□□ 0.89
HCLS1-202ENST00000428394 MBD3O95983 291 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms