RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.65□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEGF6O75095 1541 aa11.65□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBLN1P23142 703 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.64□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF4Q96M43 638 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.63□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM37O94972 964 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLSCR1O15162 318 aa11.62□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM182BQ5T319 152 aa11.62□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.62□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APBA3O96018 575 aa11.61□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.6□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.6□□□□□ -0.55
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.6□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.6□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPG7Q9UQ90 795 aa11.6□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTAF1O14981 1849 aa11.6□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EYA1Q99502 592 aa11.59□□□□□ -0.55
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.57□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.57□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP53Q96M91 514 aa11.57□□□□□ -0.56
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTHFSP49914 203 aa11.56□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF14Q5TI25 921 aa11.56□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL13P35225 146 aa11.55□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.55□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LY75O60449 1722 aa11.55□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRP5O75197 1615 aa11.54□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGB4P16144 1822 aa11.54□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.54□□□□□ -0.56
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.53□□□□□ -0.56
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RALBP1Q15311 655 aa11.52□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.52□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDCQ9Y266 331 aa11.52□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNQ2O43526 872 aa11.51□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHKG2P15735 406 aa11.51□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TXNRD1Q16881 649 aa11.51□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.51□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.51□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.5□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC4A2P04920 1241 aa11.5□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP2R1AP30153 589 aa11.5□□□□□ -0.57
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.49□□□□□ -0.57
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.49□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK32BQ9NY57 414 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRC1P22897 1456 aa11.48□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASZ1Q86V15 1759 aa11.47□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5P01031 1676 aa11.47□□□□□ -0.57
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROM2Q8N271 834 aa11.47□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.47□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.46□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PALLDQ8WX93 1383 aa11.46□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCHSD2O94868 740 aa11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC15A2Q16348 729 aa11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.44□□□□□ -0.58
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