RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 BECN1Q14457 450 aa26.13■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 EYA1Q99502 592 aa26.13■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 FOXO3O43524 673 aa26.12■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 AMPHP49418 695 aa26.1■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL11AQ9H165 835 aa26.1■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP10DQ9P241 1426 aa26.09■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 NLRP6P59044 892 aa26.09■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 LTN1O94822 1766 aa26.08■■□□□ 1.77
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXC9P31274 260 aa26.07■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 PTPRCP08575 1304 aa26.06■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.05■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MSH6P52701 1360 aa26.05■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 NFAT5O94916 1531 aa26.03■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.03■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RTL1A6NKG5 1358 aa26.03■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.02■■□□□ 1.76
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.01■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKLE2Q86XL3 938 aa26■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 ABTB2Q8N961 1025 aa26■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 DCTPP1Q9H773 170 aa25.99■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC4A2P04920 1241 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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KCNQ1-202ENST00000335475 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K5Q99683 1374 aa25.96■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNA1FO60840 1977 aa25.95■■□□□ 1.75
KCNQ1-202ENST00000335475 G2E3Q7L622 706 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-202ENST00000335475 MEIS3Q99687 375 aa25.95■■□□□ 1.74
KCNQ1-202ENST00000335475 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.94■■□□□ 1.74
KCNQ1-202ENST00000335475 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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KCNQ1-202ENST00000335475 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.91■■□□□ 1.74
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KCNQ1-202ENST00000335475 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.91■■□□□ 1.74
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KCNQ1-202ENST00000335475 IL17REQ8NFR9 667 aa25.9■■□□□ 1.74
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KCNQ1-202ENST00000335475 IP6K1Q92551 441 aa25.89■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 GSE1Q14687 1217 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.88■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 F6X3S4 739 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 C14orf37Q86TY3 774 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.87■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 SLIT3O75094 1523 aa25.86■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF2CQ99661 725 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC22Q5TAA0 569 aa25.85■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC45O75419 566 aa25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX21Q969T3 373 aa25.84■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 STK31Q9BXU1 1019 aa25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 FLIIQ13045 1269 aa25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HSCBQ8IWL3 235 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NCAPD2Q15021 1401 aa25.82■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 NBPF4Q96M43 638 aa25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.81■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 PSME1Q06323 249 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.79■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 HMMRO75330 724 aa25.77■■□□□ 1.72
KCNQ1-202ENST00000335475 DDIT3P35638 169 aa25.77■■□□□ 1.72
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