RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330070.5

HOXB2-201, Transcript of homeobox B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB2, Length 1,562 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-201ENST00000330070 APBA3O96018 575 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 NHSQ6T4R5 1651 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXB2-201ENST00000330070 PLSCR1O15162 318 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 IL13P35225 146 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 SPG7Q9UQ90 795 aa27■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 KDRP35968 1356 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXB2-201ENST00000330070 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 RREB1Q92766 1687 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 CFAP53Q96M91 514 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 CYP27B1O15528 508 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 KCNQ2O43526 872 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 PPP2R1AP30153 589 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 BTAF1O14981 1849 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXB2-201ENST00000330070 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 PHKG2P15735 406 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 RALBP1Q15311 655 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 NBPF14Q5TI25 921 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 NUDCQ9Y266 331 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB2-201ENST00000330070 TXNRD1Q16881 649 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 PROM2Q8N271 834 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 HMOX1P09601 288 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 DCAF5Q96JK2 942 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXB2-201ENST00000330070 ITGB4P16144 1822 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 LY75O60449 1722 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 PIGBQ92521 554 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 PAPPAQ13219 1627 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXB2-201ENST00000330070 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 FCHSD2O94868 740 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 PALLDQ8WX93 1383 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 STK32BQ9NY57 414 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 PRKAR2BP31323 418 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 SLC15A2Q16348 729 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB2-201ENST00000330070 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 MRC1P22897 1456 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 MAP3K5Q99683 1374 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 NEFMP07197 916 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 LRP5O75197 1615 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 AKT1S1Q96B36 256 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 ATG3Q9NT62 314 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 SIK1P57059 783 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB2-201ENST00000330070 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.8 ms