RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313116.11

ZNF41-201, Transcript of zinc finger protein 41, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF41, Length 4,297 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF41-201ENST00000313116 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 TPM2P07951 284 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 FLIIQ13045 1269 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 SNX21Q969T3 373 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 TPM4P67936 248 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 STK3Q13188 491 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 SPC24Q8NBT2 197 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 NPHP1O15259 732 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 PSMA5P28066 241 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF41-201ENST00000313116 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ABCC2Q92887 1545 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 AACSQ86V21 672 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PTPRCP08575 1304 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 FERMT3Q86UX7 667 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ACEP12821 1306 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CPLX1O14810 134 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PDCP20941 246 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 TRIM5Q9C035 493 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 DCTPP1Q9H773 170 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 BTBD11A6QL63 1104 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 MYL6BP14649 208 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PDE1AP54750 535 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 APPP05067 770 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ERC1Q8IUD2 1116 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 TMX3Q96JJ7 454 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ATP10AO60312 1499 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 SPG7Q9UQ90 795 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 FOXO3O43524 673 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ABCA8O94911 1581 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ANXA1P04083 346 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CLCN1P35523 988 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CEP85Q6P2H3 762 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 KRT85P78386 507 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 WASHC4Q2M389 1173 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 SDF4Q9BRK5 362 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 UQCRHP07919 91 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CCDC192P0DO97 292 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 ERVK-7P63135 1459 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 HIP1O00291 1037 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF41-201ENST00000313116 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 USP25Q9UHP3 1055 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 ATP7AQ04656 1500 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 RAB11FIP3O75154 756 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 KDM4AO75164 1064 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF41-201ENST00000313116 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms