RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 PEAK1Q9H792 1746 aa26.15■■□□□ 1.78
PTDSS2-201ENST00000308020 SSH2Q76I76 1423 aa26.14■■□□□ 1.78
PTDSS2-201ENST00000308020 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.774e-8■■□□□ 12.1
PTDSS2-201ENST00000308020 SLIT1O75093 1534 aa26.13■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 FSD2A1L4K1 749 aa26.13■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 CHL1O00533 1208 aa26.12■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.12■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.12■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 FOXO3O43524 673 aa26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 AMPHP49418 695 aa26.09■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 CDC45O75419 566 aa26.08■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.08■■□□□ 1.77
PTDSS2-201ENST00000308020 KCNA6P17658 529 aa26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 PANK2Q9BZ23 570 aa26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 DCTPP1Q9H773 170 aa26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 DIP2AQ14689 1571 aa26.07■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 NLRP6P59044 892 aa26.06■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.06■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 FLT4P35916 1363 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 EYA1Q99502 592 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 SBNO1A3KN83 1393 aa26.04■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.04■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGEF10O15013 1369 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.02■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS12O14924 1447 aa26.01■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 CRB1P82279 1406 aa26.01■■□□□ 1.76
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA0232Q92628 1395 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC22Q5TAA0 569 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 GBP4Q96PP9 640 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 ATP10DQ9P241 1426 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC4A2P04920 1241 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 APBB1O00213 710 aa25.99■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP85Q6P2H3 762 aa25.99■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 MSH6P52701 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 ABTB2Q8N961 1025 aa25.98■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 MRE11P49959 708 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 KDRP35968 1356 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 PIK3C2AO00443 1686 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 MEIS3Q99687 375 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 C14orf37Q86TY3 774 aa25.96■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
PTDSS2-201ENST00000308020 RTL1A6NKG5 1358 aa25.95■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPRCP08575 1304 aa25.95■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.95■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 HOXC9P31274 260 aa25.94■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 SSFA2P28290 1259 aa25.94■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 G2E3Q7L622 706 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 USP26Q9BXU7 913 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 SDSP20132 328 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 RABEP1Q15276 862 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 F6X3S4 739 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS2-201ENST00000308020 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 NECTIN2Q92692 538 aa25.86■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.86■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.86■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 PTMSP20962 102 aa25.85■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 CASC1Q6TDU7 716 aa25.85■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.85■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 STK31Q9BXU1 1019 aa25.84■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTDSS2-201ENST00000308020 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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