RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268661.7

RPL3L-201, Transcript of ribosomal protein L3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL3L, Length 2,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3L-201ENST00000268661 RBSNQ9H1K0 784 aa20.2■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 FBLN1P23142 703 aa20.19■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 ST18O60284 1047 aa20.18■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 RGS12O14924 1447 aa20.18■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 DLC1Q96QB1 1528 aa20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 SDSP20132 328 aa20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 GPT2Q8TD30 523 aa20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 CASC1Q6TDU7 716 aa20.16■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.16■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.15■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 CEP85Q6P2H3 762 aa20.15■□□□□ 0.82
RPL3L-201ENST00000268661 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 NEO1Q92859 1461 aa20.14■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 REC8O95072 547 aa20.14■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.13■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 MCM5P33992 734 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 RTL1A6NKG5 1358 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.12■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.11■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.11■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 FAM83GA6ND36 823 aa20.11■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 RICTORQ6R327 1708 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 ERC2O15083 957 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 MSH6P52701 1360 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.1■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.09■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.09■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 MBD3O95983 291 aa20.08■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 MAP7D2Q96T17 732 aa20.08■□□□□ 0.81
RPL3L-201ENST00000268661 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 RAPGEF3O95398 923 aa20.08■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 PTPRCP08575 1304 aa20.08■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 KIAA0232Q92628 1395 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 TSPOAP1O95153 1857 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 SYCE3A1L190 88 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 DCTN1Q14203 1278 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 NME9Q86XW9 330 aa20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.06■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 MCM2P49736 904 aa20.05■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 MEIS3Q99687 375 aa20.05■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 C3P01024 1663 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CHL1O00533 1208 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 BRD1O95696 1058 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CUL4AQ13619 759 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 TMX3Q96JJ7 454 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 AKAP12Q02952 1782 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CPS1P31327 1500 aa20.04■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.03■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 UQCRHP07919 91 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 PDE1AP54750 535 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 HMMRO75330 724 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 KRT24Q2M2I5 525 aa20.02■□□□□ 0.8
RPL3L-201ENST00000268661 APBB1O00213 710 aa20.01■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 NEK4P51957 841 aa20.01■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 COG3Q96JB2 828 aa20.01■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 DYNC1I1O14576 645 aa20.01■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 IL17RAQ96F46 866 aa20■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 SALL3Q9BXA9 1300 aa20■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 ITSN1Q15811 1721 aa20■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 ANAPC15P60006 121 aa19.99■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.99■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.98■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa19.98■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 TSPY26PQ9H489 355 aa19.98■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.97■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 SSH2Q76I76 1423 aa19.97■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.96■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
RPL3L-201ENST00000268661 CRB1P82279 1406 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms