RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.83■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 NF2P35240 595 aa18.83■□□□□ 0.6
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CTIF-201ENST00000256413 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
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CTIF-201ENST00000256413 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.82■□□□□ 0.6
CTIF-201ENST00000256413 STAC3Q96MF2 364 aa18.82■□□□□ 0.6
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CTIF-201ENST00000256413 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.78■□□□□ 0.6
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CTIF-201ENST00000256413 C8orf34Q49A92 452 aa18.74■□□□□ 0.59
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CTIF-201ENST00000256413 ANKRD62A6NC57 917 aa18.72■□□□□ 0.59
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CTIF-201ENST00000256413 STX1AQ16623 288 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 SLC4A2P04920 1241 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 IGHDP01880 384 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 GNG11P61952 73 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-201ENST00000256413 ATF3P18847 181 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GUL7 405 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CCDC175P0C221 793 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-201ENST00000256413 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
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