RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.72■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.72■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF428Q96B54 188 aa23.72■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PDLIM4-201ENST00000253754 SBNO1A3KN83 1393 aa23.7■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 FLT4P35916 1363 aa23.7■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 PLEKHG5O94827 1062 aa23.7■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 MCM10Q7L590 875 aa23.7■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF1AQ12756 1690 aa23.69■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 USP54Q70EL1 1684 aa23.69■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT24Q2M2I5 525 aa23.67■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.67■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 SMC5Q8IY18 1101 aa23.66■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.65■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PDLIM4-201ENST00000253754 HOXC9P31274 260 aa23.64■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.64■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.62■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 ABCC4O15439 1325 aa23.62■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.61■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 LTN1O94822 1766 aa23.61■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 GCP02774 474 aa23.61■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.6■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.6■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF10O15013 1369 aa23.6■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 NFAT5O94916 1531 aa23.6■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 CHL1O00533 1208 aa23.59■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.59■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 EYA1Q99502 592 aa23.58■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 LNPKQ9C0E8 428 aa23.58■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 SLAIN2Q9P270 581 aa23.58■■□□□ 1.37
PDLIM4-201ENST00000253754 BRINP3Q76B58 766 aa23.58■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 NUCB1Q02818 461 aa23.57■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 CRB1P82279 1406 aa23.56■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 IP6K1Q92551 441 aa23.56■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.56■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.56■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.55■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 RTL1A6NKG5 1358 aa23.55■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 ALS2Q96Q42 1657 aa23.54■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.54■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 KDRP35968 1356 aa23.54■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 SLIT3O75094 1523 aa23.54■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.53■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.53■■□□□ 1.36
PDLIM4-201ENST00000253754 RGS12O14924 1447 aa23.51■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 PXDNQ92626 1479 aa23.51■■□□□ 1.35
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PDLIM4-201ENST00000253754 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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PDLIM4-201ENST00000253754 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 KIAA0232Q92628 1395 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 NFKBIBQ15653 356 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.49■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 USP35Q9P2H5 1018 aa23.48■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 PIP4K2BP78356 416 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 GCC1Q96CN9 775 aa23.47■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PDLIM4-201ENST00000253754 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
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PDLIM4-201ENST00000253754 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF4Q96M43 638 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.45■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC4A2P04920 1241 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 BECN1Q14457 450 aa23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.43■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 G2E3Q7L622 706 aa23.42■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.42■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.42■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.42■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 RGPD5Q99666 1765 aa23.4■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 PTPRCP08575 1304 aa23.4■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.39■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 MEIS3Q99687 375 aa23.39■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP10DQ9P241 1426 aa23.39■■□□□ 1.34
PDLIM4-201ENST00000253754 F6X3S4 739 aa23.39■■□□□ 1.33
PDLIM4-201ENST00000253754 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PDLIM4-201ENST00000253754 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.38■■□□□ 1.33
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