RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	CD63	P08962	238 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM200B	P0CF97	657 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SDS	P20132	328 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX11	P35716	441 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	GGCX	P38435	758 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	LIMS1	P48059	325 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF11	P52732	1056 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PLK1	P53350	603 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB4B	P68371	445 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB2A	Q13885	445 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM189A2	Q15884	450 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	APOA5	Q6Q788	366 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FRMD6	Q96NE9	622 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ASPDH	A6ND91	283 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HHLA1	C9JL84	531 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440		H0YCG3	227 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	AREL1	O15033	823 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SPTLC2	O15270	562 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB43	O43298	467 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAM11	O75078	769 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	UBXN7	O94888	489 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	P4HA1	P13674	534 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC130	P13994	396 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGER1	P34995	402 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ACVR1B	P36896	505 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCL1	Q15111	1095 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAL	Q6DHV7	355 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	IRGC	Q6NXR0	463 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	RILPL2	Q969X0	211 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DACH2	Q96NX9	599 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	OGFR	Q9NZT2	677 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MED12	Q93074	2177 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HYKK	A2RU49	373 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R3D	O95685	299 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PIGR	P01833	764 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	UMOD	P07911	640 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM163B	P0C2L3	166 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF24	P17028	368 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	RRM1	P23921	792 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TNNC1	P63316	161 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SORD	Q00796	357 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK7	Q13164	816 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR19	Q15760	415 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	BLID	Q8IZY5	108 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		6.06	□□□□□ -1.44

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