RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF487B1APH4 448 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM253P0C7T8 217 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 GFERP55789 205 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCDC1P59894 354 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCSK7Q16549 785 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 NPNTQ6UXI9 565 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 AGAP3Q96P47 875 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF711Q9Y462 761 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 APOL1O14791 398 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHUKO15111 745 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 NKX2-8O15522 239 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK17BO94768 372 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTA2O94776 668 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 AVL9Q8NBF6 648 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLYATL1Q969I3 302 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 OLFM3Q96PB7 478 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 DEF6Q9H4E7 631 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 OGFRQ9NZT2 677 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARHGAP6O43182 974 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTX2O75431 263 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR89BP0CG08 455 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCR10P46092 362 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDK18Q07002 472 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDK1Q15118 436 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 INSCQ1MX18 579 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 COL26A1Q96A83 441 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-208ENST00000616074 CATSPER2Q96P56 530 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 UCK1Q9HA47 277 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAD18Q9NS91 495 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 COL12A1Q99715 3063 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYSRT1A8MQ03 144 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 DLGAP3O95886 979 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 C9P02748 559 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT1P04264 644 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKAR1AP10644 381 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 BPIP17213 487 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC19A1P41440 591 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABHD18Q0P651 414 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 C9orf72Q96LT7 481 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAJC7Q99615 494 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRR19A6NJB7 356 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 AURKAO14965 403 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 KMOO15229 486 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 AKR1B10O60218 316 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 UBXN7O94888 489 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 VIPP01282 170 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-208ENST00000616074 TYRP1P17643 537 aa20.46■□□□□ 0.87
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