RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PARG	Q86W56	976 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PRSS38	A1L453	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	AGAP14	A8MT82	685 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PFDN6	O15212	129 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NDUFS3	O75489	264 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CDK14	O94921	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CEACAM5	P06731	702 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SYP	P08247	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GSTA2	P09210	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CTSK	P43235	329 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GPX6	P59796	221 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	IRX4	P78413	519 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	BNC1	Q01954	994 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PPARD	Q03181	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MGAT5	Q09328	741 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	KYNU	Q16719	465 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	HID1	Q8IV36	788 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PDXP	Q96GD0	296 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	FGF22	Q9HCT0	170 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	VPS18	Q9P253	973 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	VEGFD	O43915	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SPAG6	O75602	509 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	RASGRP1	O95267	797 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ACSL3	O95573	720 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TNF	P01375	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ENG	P17813	658 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	STX2	P32856	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PHB	P35232	272 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SLC1A2	P43004	574 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GNPDA1	P46926	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TTPA	P49638	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PMS2	P54278	862 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CTBP1	Q13363	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ITIH4	Q14624	930 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TCEA2	Q15560	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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