RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ERVK-8	P63133	956 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SREBF2	Q12772	1141 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM32	Q13049	653 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM47B	Q8NA70	645 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ILVBL	A1L0T0	632 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC154	A6NI56	674 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		H3BSA7	217 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		H7C4K7	107 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MYF6	P23409	242 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CCT8	P50990	548 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KA3	P51812	740 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RBBP7	Q16576	425 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SYVN1	Q86TM6	617 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GPSM1	Q86YR5	675 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CD320	Q9NPF0	282 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM22	Q9Y584	194 aa		18.26	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WXM4	84 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH2	P05091	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A4	P31645	630 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GSK3B	P49841	420 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CYP51A1	Q16850	503 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RNF180	Q86T96	592 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM199	Q8N511	208 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ9	Q92806	393 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF382	Q96SR6	550 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ADI1	Q9BV57	179 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NACA2	Q9H009	215 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GTL3	188 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	FAM234B	A2RU67	622 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		C9JVG2	144 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		H3BNC9	293 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PRL	P01236	227 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RGR	P47804	291 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ECT2L	Q008S8	904 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MERTK	Q12866	999 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP4	Q13115	394 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MBTPS1	Q14703	1052 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6AP1	Q15904	470 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SPRED1	Q7Z699	444 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.25	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CEP350	Q5VT06	3117 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GVG6	124 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	INPP4B	O15327	924 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	BAIAP3	O94812	1187 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RASAL1	O95294	804 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN12	O95859	305 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A3	P09131	477 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31D3	P0C874	917 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CHRM3	P20309	590 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A2	P31639	672 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MC4R	P32245	332 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ESRRG	P62508	458 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LIPE	Q05469	1076 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CHST9	Q7L1S5	443 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PROSER1	Q86XN7	944 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	VPS33A	Q96AX1	596 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SMOX	Q9NWM0	555 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CD274	Q9NZQ7	290 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		18.24	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		18.24	■□□□□ 0.51

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