RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRIM4Q9C037 500 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 OR2AG1Q9H205 316 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KLHL3Q9UH77 587 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.06□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SYCE3A1L190 88 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 A6NCN8 305 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF487B1APH4 448 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CHUKO15111 745 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 KMOO15229 486 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 STK17BO94768 372 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CDK14O94921 469 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 VIPP01282 170 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GYPCP04921 128 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MMP2P08253 660 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TMEM253P0C7T8 217 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 AMD1P17707 334 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP25P42331 645 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CDK18Q07002 472 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 FOXM1Q08050 763 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ABHD18Q0P651 414 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MESDQ14696 234 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SLC18A3Q16572 532 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ALS2CLQ60I27 953 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 VSIG1Q86XK7 387 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GLYATL1Q969I3 302 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 EID2BQ96D98 161 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 AGAP3Q96P47 875 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 DEF6Q9H4E7 631 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UCK1Q9HA47 277 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IFNKQ9P0W0 207 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 NENFQ9UMX5 172 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LILRA5A6NI73 299 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 APOL1O14791 398 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 VEGFDO43915 354 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 AKR1B10O60218 316 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 MTA2O94776 668 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UBXN7O94888 489 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PIRTP0C851 137 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 VCLP18206 1134 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TCN2P20062 427 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IDSP22304 550 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 SLC19A1P41440 591 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 DCDC1P59894 354 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TLE1Q04724 770 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZBTB17Q13105 803 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 GALNT3Q14435 633 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 IL11RAQ14626 422 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PCSK7Q16549 785 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 INSCQ1MX18 579 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 ESX1Q8N693 406 aa8.04□□□□□ -1.12
COCH-211ENST00000557065 PLD5Q8N7P1 536 aa8.04□□□□□ -1.12
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