RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 OR1A2Q9Y585 309 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PPM1 405 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 IQCF5A8MTL0 148 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 METTL12A8MUP2 240 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CDH16O75309 829 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 NIPSNAP2O75323 286 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 NDUFS3O75489 264 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 IVLP07476 585 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 INHBAP08476 426 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ITGA2BP08514 1039 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CREB1P16220 341 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 MAOBP27338 520 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PMLP29590 882 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 FMO4P31512 558 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TRIM23P36406 574 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PTGER3P43115 390 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 POLD2P49005 469 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TTPAP49638 278 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CTSCP53634 463 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 LIMK2P53671 638 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CDKN2DP55273 166 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PFN3P60673 137 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CDK3Q00526 305 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SGCGQ13326 291 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ITGA9Q13797 1035 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ZNF460Q14592 562 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 RASA2Q15283 850 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TTMPQ5BVD1 217 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 MROH9Q5TGP6 573 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 LAYNQ6UX15 382 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 DET1Q7L5Y6 550 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 GALNT7Q86SF2 657 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 LONP2Q86WA8 852 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CEP97Q8IW35 865 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 DCLK2Q8N568 766 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CALML6Q8TD86 181 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ASB12Q8WXK4 309 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SNX19Q92543 992 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 NELL1Q92832 810 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 FAM136AQ96C01 138 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ULK4Q96C45 1275 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SERAC1Q96JX3 654 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SLC6A18Q96N87 628 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TCF12Q99081 682 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 GPR22Q99680 433 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SLC30A3Q99726 388 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SH3GL2Q99962 352 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TEX101Q9BY14 249 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PPC4 97 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TMEM202A6NGA9 273 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 H3BQF6 201 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 HRO43593 1189 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 LILRB5O75023 590 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 NDUFS2O75306 463 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 RFPL1O75677 317 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 FUCA1P04066 466 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 ITGB6P18564 788 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 32.6
CS-216ENST00000549221 TEAD1P28347 426 aa8.05□□□□□ -1.12
CS-216ENST00000549221 AKT1P31749 480 aa8.05□□□□□ -1.12
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