RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 CSRP2Q16527 193 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CCDC38Q502W7 563 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 VSTM1Q6UX27 236 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LEKR1Q6ZMV7 388 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CENPUQ71F23 418 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BEND5Q7L4P6 421 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DOK3Q7L591 496 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM72BQ86X60 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TDRPQ86YL5 185 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 THEM5Q8N1Q8 247 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DBF4BQ8NFT6 615 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 IRGQQ8WZA9 623 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TFAP2CQ92754 450 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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TRDN-205ENST00000546248 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OLFM3Q96PB7 478 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PIGVQ9NUD9 493 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PAK5Q9P286 719 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 STAP1Q9ULZ2 295 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PCNTO95613 3336 aa5.53□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EVPLQ92817 2033 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GMNCA6NCL1 334 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 HACD1B0YJ81 288 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 F2RL2O00254 374 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GRM6O15303 877 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CHADO15335 359 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TRAPPC3O43617 180 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 IGLV3-25P01717 112 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 C1QAP02745 245 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CD1AP06126 327 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 IVLP07476 585 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OR4Q2P0C623 313 aa5.52□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 DESP17661 470 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ERCC2P18074 760 aa5.52□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 SSTR1P30872 391 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ELK3P41970 407 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OR1G1P47890 313 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 HCAR3P49019 387 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CXCR3P49682 368 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GATMP50440 423 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TBX4P57082 545 aa5.52□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCAPQ12770 1279 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NME3Q13232 169 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DPYSQ14117 519 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RASA2Q15283 850 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FAXCQ5TGI0 409 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BSPRYQ5W0U4 402 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZNF534Q76KX8 674 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 LRRC8DQ7L1W4 858 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCD5Q86SK9 330 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.52□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 NLRP14Q86W24 1093 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MCUQ8NE86 351 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RNF139Q8WU17 664 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.52□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TTC25Q96NG3 672 aa5.52□□□□□ -1.53
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