RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 EPHA4P54764 986 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXM1Q08050 763 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 AP1B1Q10567 949 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 CDC20Q12834 499 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 KIR2DS5Q14953 304 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 NPNTQ6UXI9 565 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF157Q96PX1 679 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 OGFRQ9NZT2 677 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRJ-205ENST00000527952 SYCE3A1L190 88 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT7P08729 469 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC2A4P14672 509 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF28P17035 718 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 CASP14P31944 242 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 MESDQ14696 234 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 IGFBP7Q16270 282 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 PLD5Q8N7P1 536 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 AGAP3Q96P47 875 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 CATSPER2Q96P56 530 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TGM7Q96PF1 710 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRD1A4D1F6 860 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 RGSL1A5PLK6 1076 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 DLGAP3O95886 979 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 F8A1P23610 371 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC19A1P41440 591 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3BP2P78314 561 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 INSCQ1MX18 579 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 STARD8Q92502 1023 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIB3Q96RU7 358 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZPBPQ9BS86 351 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 IFNKQ9P0W0 207 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF711Q9Y462 761 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 NBASA2RRP1 2371 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 LILRA5A6NI73 299 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 OR5K4A6NMS3 321 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 VIPP01282 170 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 H2AFZP0C0S5 128 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 MAN1A1P33908 653 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TPM4P67936 248 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ABHD18Q0P651 414 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 H2AFVQ71UI9 128 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM48Q8IWZ4 208 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA22Q8NHS9 363 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 C9orf72Q96LT7 481 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 COL12A1Q99715 3063 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 MTA2O94776 668 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 AMD1P17707 334 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TCN2P20062 427 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 GLYATL1Q969I3 302 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ULBP3Q9BZM4 244 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 AURKAO14965 403 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 UBXN7O94888 489 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 BPIP17213 487 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 STAT5AP42229 794 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 CLCNKAP51800 687 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-205ENST00000527952 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms