RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 MYBPC3Q14896 1274 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MPPE1Q53F39 396 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 XKR7Q5GH72 579 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 TMEM198Q66K66 360 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 HTR3DQ70Z44 454 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 HID1Q8IV36 788 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 DENND1CQ8IV53 801 aa7.22□□□□□ -1.25
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TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDPRQ8NCN5 879 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 UCMAQ8WVF2 138 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ULK4Q96C45 1275 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SGF29Q96ES7 293 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZBTB18Q99592 522 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NPAS2Q99743 824 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 BDH2Q9BUT1 245 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NTMT1Q9BV86 223 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLPBQ9H078 707 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MUC3BQ9H195 1237 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 P2RY12Q9H244 342 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 AIG1Q9NVV5 245 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASIC5Q9NY37 505 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAP10Q9P2G4 905 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.22□□□□□ -1.25
TMPRSS4-208ENST00000519813 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.21□□□□□ -1.26
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TMPRSS4-208ENST00000519813 CCDC78A2IDD5 438 aa7.21□□□□□ -1.26
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TMPRSS4-208ENST00000519813 H0YAE9 185 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CBX4O00257 560 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 AURKAO14965 403 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PIP5K1BO14986 540 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MUSKO15146 869 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC16A5O15375 505 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RGS14O43566 566 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ECI2O75521 394 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 H6PDO95479 791 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 VNN2O95498 520 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 GLUD1P00367 558 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 IL6P05231 212 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 HMBSP08397 361 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 EBLN1P0CF75 366 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ELNP15502 786 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 LAG3P18627 525 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATF6P18850 670 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAX7P23759 505 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC6A4P31645 630 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 MC4RP32245 332 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 HNMTP50135 292 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCR3P51677 355 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 AQP4P55087 323 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 NME5P56597 212 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RHOAP61586 193 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC7A9P82251 487 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 BCL2L1Q07817 233 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNC3Q14003 757 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 IHHQ14623 411 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 TGFBIQ15582 683 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR4D1Q15615 310 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.21□□□□□ -1.26
TMPRSS4-208ENST00000519813 RTP2Q5QGT7 225 aa7.21□□□□□ -1.26
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