RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA18Q8TC71 538 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HASPINQ8TF76 798 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PTERQ96BW5 349 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 MAP2K7O14733 419 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 PEX1O43933 1283 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 FTCDO95954 541 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF81P51508 661 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 EFNA5P52803 228 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GMFBP60983 142 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SHEQ5VZ18 495 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NOTUMQ6P988 496 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DLK2Q6UY11 383 aa2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 HOOK3Q86VS8 718 aa2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC16A2P36021 539 aa2.25□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ASMTP46597 345 aa2.25□□□□□ -2.05
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