RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
APTX-232ENST00000495360 KLC4Q9NSK0 619 aa17.09■□□□□ 0.33
APTX-232ENST00000495360 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.09■□□□□ 0.33
APTX-232ENST00000495360 RSPH14Q9UHP6 348 aa17.09■□□□□ 0.33
APTX-232ENST00000495360 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 A0A0G2JNG1 304 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 MACROD2A1Z1Q3 448 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 A6NCN8 305 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 C9orf172C9J069 976 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 K7ENP7 123 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 KIR2DS3K7RE56 304 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ERVH48-1M5A8F1 160 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TK2O00142 265 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 MTX2O75431 263 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 EPOP01588 193 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PRB1P04280 392 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 THRAP10827 490 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CCL4P13236 92 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 HMGCLP35914 325 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 COPS2P61201 443 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CFHR1Q03591 330 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 MPP3Q13368 585 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 XRCC4Q13426 336 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 KIR2DS5Q14953 304 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TGIF1Q15583 401 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 INSCQ1MX18 579 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TMEM164Q5U3C3 297 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 SH3KBP1Q96B97 665 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TRABDQ9H4I3 376 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PRDM8Q9NQV8 689 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 HACD3Q9P035 362 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TRHDEQ9UKU6 1024 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 DUSP10Q9Y6W6 482 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 KIF26BQ2KJY2 2108 aa17.08■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 OR5K4A6NMS3 321 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CHUKO15111 745 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 KMOO15229 486 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 VEGFDO43915 354 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 HLA-DPA1P20036 260 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 RBL1P28749 1068 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CLCNKAP51800 687 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 SLC1A5Q15758 541 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TMEM71Q6P5X7 295 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ZFAND4Q86XD8 727 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 AGBL5Q8NDL9 886 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ACTL9Q8TC94 416 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 VPS35Q96QK1 796 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 NBEAQ8NFP9 2946 aa17.07■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 SCN8AQ9UQD0 1980 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CCDC66A2RUB6 948 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 BTNL10A8MVZ5 291 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PJA2O43164 708 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CDK14O94921 469 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CTNNA2P26232 953 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 18.9
APTX-232ENST00000495360 SPAM1P38567 509 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 MAPK9P45984 424 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 GTF2H3Q13889 308 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PCSK4Q6UW60 755 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 AVL9Q8NBF6 648 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 GDAP1Q8TB36 358 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 FERMT1Q9BQL6 677 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 OSBPL8Q9BZF1 889 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 B3GNT4Q9C0J1 378 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 LACRTQ9GZZ8 138 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 GBA3Q9H227 469 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CPNE7Q9UBL6 633 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 EFR3BQ9Y2G0 817 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 CD82P27701 267 aa17.05■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 PTPN7P35236 360 aa17.05■□□□□ 0.32
APTX-232ENST00000495360 VAV2P52735 878 aa17.05■□□□□ 0.32
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