RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MREGQ8N565 214 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FBF1Q8TES7 1133 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 COX14Q96I36 57 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RUFY1Q96T51 708 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.77□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR1A2Q9Y585 309 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 POM121BA6NF01 834 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 E5RI56 91 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 KPNA5O15131 536 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A9O60656 530 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KCNJ13O60928 360 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RASGRP1O95267 797 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CER1O95813 267 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SOD1P00441 154 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ESR1P03372 595 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RETP07949 1114 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM153BP0C7A2 387 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MYBL2P10244 700 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A6P19224 532 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A1P22309 533 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A4P22310 534 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.052e-30■■■□□ 14.8
ACTB-213ENST00000493945 MAOBP27338 520 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A3P35503 534 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A5P35504 534 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GP5P40197 560 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MPLP40238 635 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC1A2P43004 574 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CD151P48509 253 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PPARDQ03181 441 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DBN1Q16643 649 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM153CQ494X1 144 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 DOK6Q6PKX4 331 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PRSS33Q8NF86 280 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 AGAP2Q99490 1192 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FUT8Q9BYC5 575 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 NCDNQ9UBB6 729 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FETUBQ9UGM5 382 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GPR34Q9UPC5 381 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CACNA1HO95180 2353 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PI4KAP42356 2102 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR51F1A6NGY5 319 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 FAM159BA6NKW6 160 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KMOO15229 486 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TNFP01375 233 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 UQCRHP07919 91 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CNTFP26441 200 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ARNTP27540 789 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 MSH2P43246 934 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SERPINB9P50453 376 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 SLC12A2P55011 1212 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 GPX6P59796 221 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TCF15Q12870 199 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LRP8Q14114 963 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TMED2Q15363 201 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 PPM1NQ8N819 430 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 OR13H1Q8NG92 308 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 VPS39Q96JC1 886 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 BMFQ96LC9 184 aa14.75□□□□□ -0.05
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