RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 DDIASQ8IXT1 998 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CLYBLQ8N0X4 340 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HDDC3Q8N4P3 179 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DBF4BQ8NFT6 615 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OCC1Q8TAD7 63 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SMC6Q96SB8 1091 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 OLFM1Q99784 485 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM79Q9BSE2 394 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF350Q9GZX5 532 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCG8Q9H221 673 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TASP1Q9H6P5 420 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FETUBQ9UGM5 382 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KAT6AQ92794 2004 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NDC80O14777 642 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB43O43298 467 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 VEGFDO43915 354 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ESRRBO95718 433 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RLN1P04808 185 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CYC1P08574 325 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ITIH1P19827 911 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NMBRP28336 390 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MPLP40238 635 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 AVPR1BP47901 424 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ADARP55265 1226 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MTSS1LQ765P7 747 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFAND2BQ8WV99 257 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 RITA1Q96K30 269 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 COQ10AQ96MF6 247 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM7Q9C029 511 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS18Q9P253 973 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 STK39Q9UEW8 545 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CHKBQ9Y259 395 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM17Q9Y577 477 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SYCE3A1L190 88 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf52A6NGY3 159 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 YDJCA8MPS7 323 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 M0QZ24 198 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PLSCR1O15162 318 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ST8SIA3O43173 380 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF202O95125 648 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFB4O95168 129 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK5O95279 499 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MOCS3O95396 460 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAZP19086 355 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP11B2P19099 503 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CD58P19256 250 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF81P51508 661 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GPC3P51654 580 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TMPRSS3P57727 454 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 PROSER3Q2NL68 480 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT11Q495W5 492 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MCM10Q7L590 875 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPREQ86SM8 312 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 TLK2Q86UE8 772 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 EXD1Q8NHP7 514 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ST7LQ8TDW4 575 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HASPINQ8TF76 798 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ATL1Q8WXF7 558 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 CAVIN3Q969G5 261 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 ERGIC1Q969X5 290 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms