RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 SUN2Q9UH99 717 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GTW7 788 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 OR1I1O60431 355 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NIPSNAP2O75323 286 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PRLP01236 227 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 COL6A1P12109 1028 aa18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 CR2P20023 1033 aa18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 GRIK2Q13002 908 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 NHSL2Q5HYW2 709 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 BORAQ6PGQ7 559 aa18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 CBR4Q8N4T8 237 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM14Q96QK8 99 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SLC30A3Q99726 388 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 MARCH5Q9NX47 278 aa18.17■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.17■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 H3BNH8 94 aa18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC22A3O75751 556 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF23P17027 643 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SLC11A1P49279 550 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FAM47BQ8NA70 645 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 MUC13Q9H3R2 512 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 BPIFA1Q9NP55 256 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ILVBLA1L0T0 632 aa18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 H3BNC9 293 aa18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 PRR35P0CG20 571 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FUT11Q495W5 492 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 ESAMQ96AP7 390 aa18.16■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 TEX37Q96LM6 180 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf50Q9BV19 199 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 MUC3BQ9H195 1237 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 OLAHQ9NV23 265 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TMCO1Q9UM00 188 aa18.16■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 GPIP06744 558 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31D3P0C874 917 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 UGT1A6P19224 532 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 GATMP50440 423 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ERVK-8P63133 956 aa18.15■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TFAP2CQ92754 450 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 KCNJ9Q92806 393 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 MYRFLQ96LU7 910 aa18.15■□□□□ 0.5
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SYNE4-204ENST00000465425 TTPALQ9BTX7 342 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 C9orf16Q9BUW7 83 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF225Q9UK10 706 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GVG6 124 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 PDLIM1O00151 329 aa18.15■□□□□ 0.5
SYNE4-204ENST00000465425 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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