RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 OGFOD2Q6N063 350 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 LINGO1Q96FE5 620 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CD274Q9NZQ7 290 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 A0A1B0GVG6 124 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PP18 115 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ARPC2O15144 300 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PFDN6O15212 129 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 H6PDO95479 791 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 UROSP10746 265 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TTPAP49638 278 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 IL2P60568 153 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 SMARCB1Q12824 385 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FUT11Q495W5 492 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RABL3Q5HYI8 236 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GPSM1Q86YR5 675 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CBR4Q8N4T8 237 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 HAUS8Q9BT25 410 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 MUC3BQ9H195 1237 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RNF186Q9NXI6 227 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PADI4Q9UM07 663 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 E5RI56 91 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 H7C4K7 107 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D4O60343 1298 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TSPAN12O95859 305 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 OXTRP30559 389 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 COQ5Q5HYK3 327 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 LCN8Q6JVE9 175 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 LINGO4Q6UY18 593 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TTPALQ9BTX7 342 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GKN1Q9NS71 199 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 AIG1Q9NVV5 245 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ASB1Q9Y576 335 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PDLIM1O00151 329 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PLOD2O00469 737 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 COCHO43405 550 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 KLKB1P03952 638 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 IRF1P10914 325 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 HK3P52790 923 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 UFM1P61960 85 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RCAN2Q14206 197 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ADRM1Q16186 407 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CD200R1Q8TD46 325 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ALG2Q9H553 416 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.29■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ILVBLA1L0T0 632 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CCDC154A6NI56 674 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 ADAM12O43184 909 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 GPR39O43194 453 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 SLC22A3O75751 556 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PRR35P0CG20 571 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CES1P23141 567 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FOXM1Q08050 763 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 FAM47BQ8NA70 645 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 OR2T11Q8NH01 316 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 CDK15Q96Q40 435 aa20.28■□□□□ 0.84
IMP4-208ENST00000460766 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.28■□□□□ 0.84
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