RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 FASLGP48023 281 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 PDE1BQ01064 536 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 ITGA9Q13797 1035 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 AMZ1Q400G9 498 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 IYDQ6PHW0 289 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 TTC25Q96NG3 672 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPN4-208ENST00000460289 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 OR5K4A6NMS3 321 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 CRTAMO95727 393 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 GTF2H3Q13889 308 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 RPS6KA1Q15418 735 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM159Q96B96 161 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 APOL2Q9BQE5 337 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KLC4Q9NSK0 619 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 A0A0G2JNG1 304 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 PLD2O14939 933 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SNX2O60749 519 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 MTX2O75431 263 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 F3P13726 295 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SQSTM1Q13501 440 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KIR2DS5Q14953 304 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 CHRNA6Q15825 494 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 INSCQ1MX18 579 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 P3H1Q32P28 736 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 MAP9Q49MG5 647 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 AVL9Q8NBF6 648 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SLC38A3Q99624 504 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 LHX6Q9UPM6 363 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ARL5AQ9Y689 179 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 PSMD3O43242 534 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A9O60656 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 TNFSF15O95150 251 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 EML2O95834 649 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A6P19224 532 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A1P22309 533 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A4P22310 534 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 CD1CP29017 333 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A3P35503 534 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A5P35504 534 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ABCG1P45844 678 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 GPLD1P80108 840 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 OLIG2Q13516 323 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 USP53Q70EK8 1073 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF398Q8TD17 642 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 RDH14Q9HBH5 336 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPN4-208ENST00000460289 A6NCN8 305 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms