RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CIPCQ9C0C6 399 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 APPL1Q9UKG1 709 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RB1P06400 928 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SPAM1P38567 509 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 VIPR2P41587 438 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 AGTR2P50052 363 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 USP45Q70EL2 814 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.99■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GTL3 188 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TTC34A8MYJ7 566 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEC1O60732 1142 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6AP2O75787 350 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TM7SF2O76062 418 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CDK14O94921 469 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SNX32Q86XE0 403 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEC3Q8TD91 643 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ESAMQ96AP7 390 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CEP44Q9C0F1 390 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ACRV1P26436 265 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 HK3P52790 923 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 FOXA1P55317 472 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 PTSQ03393 145 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF366Q8N895 744 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 FAR2Q96K12 515 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA7Q96RP8 456 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 LYSMD1Q96S90 227 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 BRD9Q9H8M2 597 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ERVW-1Q9UQF0 538 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.98■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF197O14709 1029 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM16O95361 564 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RBFAQ8N0V3 343 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 SYCE1LA8MT33 242 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CD9P21926 228 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RAP1GDS1P52306 607 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 DHCR24Q15392 516 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.97■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 A0A088AWK7 358 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ITGAXP20702 1163 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 GPSM1Q86YR5 675 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 AHI1Q8N157 1196 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CD84Q9UIB8 345 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CDH22Q9UJ99 828 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 DHRS7Q9Y394 339 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 AIM2O14862 343 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CYP17A1P05093 508 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf40Q86WS4 652 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf30Q96M34 536 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TTC1Q99614 292 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 CD274Q9NZQ7 290 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 MARK1Q9P0L2 795 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 ASB1Q9Y576 335 aa22.96■■□□□ 1.27
FAAP20-209ENST00000428120 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 PRDX6P30041 224 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 PBX2P40425 430 aa22.95■■□□□ 1.26
FAAP20-209ENST00000428120 NRIP1P48552 1158 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms