RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 NFKB1P19838 968 aa26.89■■□□□ 1.9
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LMO1-202ENST00000428101 SLC9B2Q86UD5 537 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO1-202ENST00000428101 VASH2Q86V25 355 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO1-202ENST00000428101 CCDC170Q8IYT3 715 aa26.89■■□□□ 1.9
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LMO1-202ENST00000428101 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa26.87■■□□□ 1.89
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LMO1-202ENST00000428101 B4E171 279 aa26.85■■□□□ 1.89
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LMO1-202ENST00000428101 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.85■■□□□ 1.89
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LMO1-202ENST00000428101 RCCD1A6NED2 376 aa26.84■■□□□ 1.89
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LMO1-202ENST00000428101 HACD1B0YJ81 288 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 KMOO15229 486 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 VEGFDO43915 354 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 INSCQ1MX18 579 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 BBS12Q6ZW61 710 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 DAAM2Q86T65 1068 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 LRRTM4Q86VH4 590 aa26.84■■□□□ 1.89
LMO1-202ENST00000428101 FAM129CQ86XR2 697 aa26.84■■□□□ 1.89
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