RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CNTN1Q12860 1018 aa9.52□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM114B3SHH9 223 aa9.51□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 TARM1B6A8C7 271 aa9.51□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.51□□□□□ -0.89
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HDLBP-211ENST00000425989 COL4A2P08572 1712 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.5□□□□□ -0.89
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