RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 NME5P56597 212 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CARM1Q86X55 608 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 DERL2Q9GZP9 239 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCO1Q9UM00 188 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SOD2P04179 222 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 GFAPP14136 432 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1B2P21281 511 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SCNN1BP51168 640 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 GEN1Q17RS7 908 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MGME1Q9BQP7 344 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GTL3 188 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC160A6NGH7 325 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCQ05315 142 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 C5orf22Q49AR2 442 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 DDIASQ8IXT1 998 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKFN1Q8N957 763 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CIB1Q99828 191 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 POLG2Q9UHN1 485 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 LCHNA4D1U4 455 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF839A8K0R7 811 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 FXYD1O00168 92 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP2P12643 396 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 LBPP18428 481 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIA3P42263 894 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 LCP2Q13094 533 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GTW7 788 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TIPRLO75663 272 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 RHOBTB1O94844 696 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCC1O94876 653 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 STAMBPO95630 424 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00032P0C843 101 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 IL1RL2Q9HB29 575 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HSD17B1P14061 328 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HGFP14210 728 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 FMO4P31512 558 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF112Q9ULX5 631 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM50BQ9Y247 325 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BSA7 217 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGPT2O15123 496 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SUPT3HO75486 399 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 H6PDO95479 791 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 URODP06132 367 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMA3P25788 255 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V0D1P61421 351 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM110BQ8TC76 370 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 PSKH2Q96QS6 385 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 HAUS8Q9BT25 410 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEH1Q9H213 219 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 OLAHQ9NV23 265 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 THEGQ9P2T0 379 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 BTRCQ9Y297 605 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 AQP12BA6NM10 295 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ECI2O75521 394 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP1-201ENST00000357436 ABLIM3O94929 683 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms