RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343245.7

ATG5-201, Transcript of autophagy related 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG5, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5-201ENST00000343245 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 LRRC66Q68CR7 880 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PDPRQ8NCN5 879 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 AGAP11Q8TF27 550 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 ASB16Q96NS5 453 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CLPBQ9H078 707 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 ASB8Q9H765 288 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GDE1Q9NZC3 331 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.71□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 A8MUI8 341 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 THRAP10827 490 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 COX4I1P13073 169 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 LCP2Q13094 533 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 TTC23LQ6PF05 361 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GPR26Q8NDV2 337 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 LINGO1Q96FE5 620 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 RDH14Q9HBH5 336 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PEX11AO75192 247 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CDK14O94921 469 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.066e-13■■■■□ 20.2
ATG5-201ENST00000343245 VIPR1P32241 457 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CA5AP35218 305 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 NSG1P42857 185 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SPINT3P49223 89 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CHRNA6Q15825 494 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GEN1Q17RS7 908 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PHF21BQ96EK2 531 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CCT7Q99832 543 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 BRD9Q9H8M2 597 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PCTPQ9UKL6 214 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 MLYCDO95822 493 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PIK3R1P27986 724 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 EPHA3P29320 983 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GCKP35557 465 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 DPPA4Q7L190 304 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 FBXO27Q8NI29 283 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 OARD1Q9Y530 152 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 E5RI56 91 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 E9PBE3 544 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CDC7O00311 574 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 DCXO43602 365 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 KLHL41O60662 606 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 VPS4BO75351 444 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 DGKGP49619 791 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 HK3P52790 923 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SH3BP2P78314 561 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SBSNQ6UWP8 590 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 Q6ZVU0 165 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PSMD11O00231 422 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 NFATC1O95644 943 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 BMP1P13497 986 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 GM2AP17900 193 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 FCARP24071 287 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PGM1P36871 562 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SQLEQ14534 574 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 CHST14Q8NCH0 376 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 SMARCD2Q92925 531 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG5-201ENST00000343245 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms