RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC28Q9NX36 388 aa19■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 IKZF3Q9UKT9 509 aa19■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 COL4A3Q01955 1670 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 UNC80Q8N2C7 3258 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 KERAO60938 352 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 KAT7O95251 611 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 IDH3AP50213 366 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 DPPA4Q7L190 304 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TMIEQ8NEW7 156 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 EXT2Q93063 718 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 LINGO1Q96FE5 620 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 COG4Q9H9E3 785 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PPM1HQ9ULR3 514 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 RNF112Q9ULX5 631 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.99■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 UBXN8O00124 270 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 CDC7O00311 574 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 BTN3A1O00481 513 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 FCHO1O14526 889 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ECI2O75521 394 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 UNC5CO95185 931 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MTHFD2P13995 350 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 NSG1P42857 185 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MTHFRP42898 656 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ERAP2Q6P179 960 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MACC1Q6ZN28 852 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ULK4Q96C45 1275 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 COPS8Q99627 209 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MATN2O00339 956 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 LTBRP36941 435 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 HK2P52789 917 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 NCALDP61601 193 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 RALGDSQ12967 914 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 Q6ZVL8 140 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 INPP5DQ92835 1189 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 FAM129BQ96TA1 746 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SPATA16Q9BXB7 569 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ABCG8Q9H221 673 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SAR1AQ9NR31 198 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.98■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 CCDC22O60826 627 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 DIAPH2O60879 1101 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ATP5HO75947 161 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TRIM16O95361 564 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 T-ENOLP0DO92 83 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ITGB6P18564 788 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 MMP12P39900 470 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ETV3P41162 512 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 GRIA2P42262 883 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 IL12RB1P42701 662 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 METAP1P53582 386 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 DCDC1P59894 354 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 HERVK_113P63132 956 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 TUBB3Q13509 450 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 GRIN2CQ14957 1233 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PFKFB4Q16877 469 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 EPGNQ6UW88 154 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SUSD6Q92537 303 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SCAMP4Q969E2 229 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ERVK-6Q9BXR3 956 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 HCN2Q9UL51 889 aa18.97■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 CCDC189A1A4V9 331 aa18.96■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ANTXRLA6NF34 631 aa18.96■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SYCE1LA8MT33 242 aa18.96■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.96■□□□□ 0.63
UPP1-201ENST00000331803 ARNTLO00327 626 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms