RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.18■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.18■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPAM1P38567 509 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACOX1Q15067 660 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZVL8 140 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OLFM1Q99784 485 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PREBQ9HCU5 417 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FSBPO95073 299 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF30P17039 623 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.16■□□□□ 0.82
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