RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221232.9

CNOT3-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT3, Length 2,852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3-201ENST00000221232 CYGBQ8WWM9 190 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 LCHNA4D1U4 455 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OR6C75A6NL08 312 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ARPC2O15144 300 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GGT5P36269 586 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FAM189BP81408 668 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 NCSTNQ92542 709 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ROPN1LQ96C74 230 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 DERL2Q9GZP9 239 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 MAGEH1Q9H213 219 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ABCG8Q9H221 673 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.5□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 C2orf78A6NCI8 922 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ASPDHA6ND91 283 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CCDC154A6NI56 674 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 K7ERQ8 282 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 VPS26AO75436 327 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 IL10P22301 178 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 HTR6P50406 440 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SUOXP51687 545 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CREB5Q02930 508 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 LIPEQ05469 1076 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TRAF2Q12933 501 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TAF12Q16514 161 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 HIC2Q96JB3 615 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 OLAHQ9NV23 265 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GID8Q9NWU2 228 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 H3BNC9 293 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 NBNO60934 754 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PAX3P23760 479 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 IL12AP29459 219 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GSK3BP49841 420 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 DGKQP52824 942 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 IL2P60568 153 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 MAP7Q14244 749 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SGO1Q5FBB7 561 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FATE1Q969F0 183 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PPM1MQ96MI6 270 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CASD1Q96PB1 797 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.49□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 KDELR3O43731 214 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 BNIP3LO60238 219 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 SLC22A3O75751 556 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PYGLP06737 847 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 IDO1P14902 403 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CA5AP35218 305 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GDF5P43026 501 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 RING1Q06587 406 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TCTN1Q2MV58 587 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 FBXL20Q96IG2 436 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 ZNF599Q96NL3 588 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TCF12Q99081 682 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PCTPQ9UKL6 214 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 H6PDO95479 791 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 C1RP00736 705 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 CAPNS1P04632 268 aa14.48□□□□□ -0.09
CNOT3-201ENST00000221232 GALTP07902 379 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms