RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS4AQ9UN37 437 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 C9JVG2 144 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 YIPF1Q9Y548 306 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PRU2 124 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PGM3O95394 542 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGER3P43115 390 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 IL23RQ5VWK5 629 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 BHLHB9Q6PI77 547 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SPACA7Q96KW9 195 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 RGPD5Q99666 1765 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL5AQ9Y689 179 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIN2DO15399 1336 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GSAPA4D1B5 854 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFS2O75306 463 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10G6Q8NH81 332 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PPCDCQ96CD2 204 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MPP4Q96JB8 637 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 FEM1CQ96JP0 617 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 FIZ1Q96SL8 496 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51F1A6NGY5 319 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD8P48556 350 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CPA6Q8N4T0 437 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMG2Q02383 582 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MIEF2Q96C03 454 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NPY6RQ99463 290 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 UMPSP11172 480 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MYL12AP19105 171 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 EDNRBP24530 442 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNQ1P51787 676 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP4F2P78329 520 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GAD2Q05329 585 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL3Q9UH77 587 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CDH22Q9UJ99 828 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBC1P01850 177 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 IFNA16P05015 189 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KIR3DL1P43629 444 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CAP1Q01518 475 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ11Q14654 390 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MIOSQ9NXC5 875 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PIRO00625 290 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4F21O95013 312 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CLDN9O95484 217 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 SSR2P43308 183 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 NEMP2A6NFY4 417 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRDO14764 452 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ZW10O43264 779 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 GNRH1P01148 92 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CPTPQ5TA50 214 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 CHSY3Q70JA7 882 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-208ENST00000615445 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms