RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL15	Q16663	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MED25	Q71SY5	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SCML4	Q8N228	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EMC1	Q8N766	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KAT2B	Q92831	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PPM1	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM170A	A1A519	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HAS3	O00219	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPN9	O14815	690 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP2C2	O75185	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPAG7	O75391	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DAB1	O75553	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL2	O95198	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GJB1	P08034	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TCF4	P15884	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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