RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	KEL	P23276	732 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	ARNT	P27540	789 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	FOXN2	P32314	431 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	CA5A	P35218	305 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	NXPH1	P58417	271 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	VSNL1	P62760	191 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	OVGP1	Q12889	678 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MYBL2	P10244	700 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MSH3	P20585	1137 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MCM3	P25205	808 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PML	P29590	882 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SSTR1	P30872	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NHLH1	Q02575	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CBLB	Q13191	982 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	CERS2	Q96G23	380 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	COX14	Q96I36	57 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TTC1	Q99614	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	COPS8	Q99627	209 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	LRP4	O75096	1905 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SCAMP1	O15126	338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	RALB	P11234	206 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ACRV1	P26436	265 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	POLD2	P49005	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	GRIK2	Q13002	908 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	FZD2	Q14332	565 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	DBN1	Q16643	649 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TCF25-223	ENST00000568870	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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