RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	HACD3	Q9P035	362 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	VPS18	Q9P253	973 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PQM1	296 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CHUK	O15111	745 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	LDB2	O43679	373 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	NRDC	O43847	1150 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CEP104	O60308	925 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ECEL1	O95672	775 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	AP2A1	O95782	977 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TPH1	P17752	444 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	KCNJ1	P48048	391 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPIA	P49247	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	XIAP	P98170	497 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCNG2	Q16589	344 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	P3H1	Q32P28	736 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GLMN	Q92990	594 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	OR2AG1	Q9H205	316 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCL22	O00626	93 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPM1D	O15297	605 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRID2	O43424	1007 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	B4GAT1	O43505	415 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	IFNB1	P01574	187 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPAM1	P38567	509 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACTR1B	P42025	376 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRIA1	P42261	906 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDX1	P52945	283 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACTR1A	P61163	376 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCL7	P80098	99 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PEX6	Q13608	980 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	NAT6	Q93015	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112		A6NCN8	305 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACP5	P13686	325 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	GLB1	P16278	677 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMPRSS15	P98073	1019 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP4F3	Q08477	520 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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