RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	RENBP	P51606	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	STC1	P52823	247 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCZ1B	P86790	482 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RAD51	Q06609	339 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OVGP1	Q12889	678 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PTPRCAP	Q14761	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ACOX1	Q15067	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPA17	Q15506	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PNCK	Q6P2M8	343 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KDELC1	Q6UW63	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DAAM2	Q86T65	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF567	Q8N184	647 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OR4C6	Q8NH72	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LMX1A	Q8TE12	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NAT14	Q8WUY8	206 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DTD2	Q96FN9	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SCRN2	Q96FV2	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ABCG8	Q9H221	673 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DONSON	Q9NYP3	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM131	Q92545	1883 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KNTC1	P50748	2209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CFAP69	A5D8W1	941 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AQP9	O43315	295 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PMPCB	O75439	489 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	EML2	O95834	649 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	B3GALT4	O96024	378 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CEACAM5	P06731	702 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TGM2	P21980	687 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HK3	P52790	923 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CDK3	Q00526	305 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ELP6	Q0PNE2	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GRM3	Q14832	879 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NFATC4	Q14934	902 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PDK1	Q15118	436 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TEX44	Q53QW1	395 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ERAP2	Q6P179	960 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GUSBP11	Q6P575	273 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MACC1	Q6ZN28	852 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PARG	Q86W56	976 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	VSIG1	Q86XK7	387 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HID1	Q8IV36	788 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SHISA5	Q8N114	240 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KY	Q8NBH2	561 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GPR26	Q8NDV2	337 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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