RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 STAMBPO95630 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TSPAN12O95859 305 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 KLKB1P03952 638 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PRSS56P0CW18 603 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 HSD17B1P14061 328 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FMO4P31512 558 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SLC7A2P52569 658 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FOXA1P55317 472 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 RALGDSQ12967 914 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 BNIP2Q12982 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NOGQ13253 232 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 GEN1Q17RS7 908 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 XKR7Q5GH72 579 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 RETREG3Q86VR2 466 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 DENND1CQ8IV53 801 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 RELTQ969Z4 430 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 GPR21Q99679 349 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CCT7Q99832 543 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TRIM15Q9C019 465 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FAM50BQ9Y247 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FXYD1O00168 92 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NR5A2O00482 541 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PPP6CO00743 305 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ANGPT2O15123 496 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ADAM12O43184 909 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TNFAIP8O95379 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ESRRBO95718 433 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 GNRH1P01148 92 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ESR1P03372 595 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 INHAP05111 366 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CAPN3P20807 821 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 MC4RP32245 332 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 GRIA2P42262 883 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SGSHP51688 502 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ARF5P84085 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PTPRNQ16849 979 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 DHFR2Q86XF0 187 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 STK40Q8N2I9 435 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 OR2T3Q8NH03 318 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SVIPQ8NHG7 77 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 RAET1EQ8TD07 263 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CD200R1Q8TD46 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 EXOC2Q96KP1 924 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF597Q96LX8 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 MUC13Q9H3R2 512 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 AIG1Q9NVV5 245 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 GID8Q9NWU2 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PCTPQ9UKL6 214 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 PADI4Q9UM07 663 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 BTN3A1O00481 513 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 TMCC1O94876 653 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CD160O95971 181 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-208ENST00000542557 CHEK2O96017 543 aa6.49□□□□□ -1.37
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