RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533719.1

AIFM1-208, Transcript of apoptosis inducing factor mitochondria associated 1, human

TSL 2

Gene AIFM1, Length 845 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AIFM1-208	ENST00000533719	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	FMO4	P31512	558 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NSG1	P42857	185 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CCDC153	Q494R4	210 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KLC3	Q6P597	504 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719		Q6ZS52	159 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719		Q6ZVL8	140 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KBTBD6	Q86V97	674 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KCNJ9	Q92806	393 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	AP2M1	Q96CW1	435 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	COQ10A	Q96MF6	247 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	FZD4	Q9ULV1	537 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.75	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SHISA7	A6NL88	538 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	AGAP14	A8MT82	685 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	OR1I1	O60431	355 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	MMP20	O60882	483 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NIPSNAP2	O75323	286 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TM7SF2	O76062	418 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PCDH8	O95206	1070 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NEFH	P12036	1026 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	COL6A2	P12110	1019 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT1A6	P19224	532 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NDUFV2	P19404	249 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT1A1	P22309	533 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT1A4	P22310	534 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	LSP1	P33241	339 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT1A3	P35503	534 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT1A5	P35504	534 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CSRP3	P50461	194 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CDKN2D	P55273	166 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	MPP2	Q14168	576 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PPM1J	Q5JR12	505 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CLEC14A	Q86T13	490 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SCAMP4	Q969E2	229 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	VPS35	Q96QK1	796 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	ABCG8	Q9H221	673 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PREB	Q9HCU5	417 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	VWA7	Q9Y334	891 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.74	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		10.73	□□□□□ -0.69
AIFM1-208	ENST00000533719	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.73	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms