RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 GRK7Q8WTQ7 553 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 NUS1Q96E22 293 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TRABDQ9H4I3 376 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 IL17CQ9P0M4 197 aa18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 KCTD3Q9Y597 815 aa18.49■□□□□ 0.55
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PUF60-218ENST00000531995 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PCCBP05166 539 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 BPIP17213 487 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 HMGCLP35914 325 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 THOP1P52888 689 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 C2orf54Q08AI8 447 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 C1orf61Q13536 156 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PTK6Q13882 451 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PRRT3Q5FWE3 981 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZNF534Q76KX8 674 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZNF765Q7L2R6 523 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PHACTR4Q8IZ21 702 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GPR26Q8NDV2 337 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZNF248Q8NDW4 579 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 BRSK1Q8TDC3 778 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CPT1BQ92523 772 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 KRT12Q99456 494 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 LRRC61Q9BV99 259 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GPR63Q9BZJ6 419 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 HACD3Q9P035 362 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SATB2Q9UPW6 733 aa18.48■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 RGSL1A5PLK6 1076 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 LDB2O43679 373 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TPSB2P20231 275 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TERF1P54274 439 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 MTM1Q13496 603 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 NR0B2Q15466 257 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TPSAB1Q15661 275 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PERM1Q5SV97 790 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 LINC00523Q86TU6 105 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CCHCR1Q8TD31 782 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 HIC2Q96JB3 615 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 APOOQ9BUR5 198 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 BPIFA1Q9NP55 256 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ARL5AQ9Y689 179 aa18.47■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 E7EVH7 732 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TTI1O43156 1089 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TMEM63AO94886 807 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GAS8O95995 478 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 LMAN1P49257 510 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 YPEL5P62699 121 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 DR1Q01658 176 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ISXQ2M1V0 245 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 JAMLQ86YT9 394 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 KCNE4Q8WWG9 221 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 AP2M1Q96CW1 435 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 LGR4Q9BXB1 951 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TEX101Q9BY14 249 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 SPASTQ9UBP0 616 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 OR1A2Q9Y585 309 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.46■□□□□ 0.55
PUF60-218ENST00000531995 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.45■□□□□ 0.54
PUF60-218ENST00000531995 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.45■□□□□ 0.54
PUF60-218ENST00000531995 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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