RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	UGT1A1	P22309	533 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ABCD3	P28288	659 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	AHR	P35869	848 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	COG7	P83436	770 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	GRIK2	Q13002	908 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	GSTA3	Q16772	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	STPG4	Q8N801	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.09	□□□□□ -1.75
COPS5-208	ENST00000519057	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NCAM2	O15394	837 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KCNN4	O15554	427 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HOXC9	P31274	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	AMPH	P49418	695 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.08	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		M0QZ24	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	WISP2	O76076	250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	IL7R	P16871	459 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF23	P17027	643 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057		Q75L30	129 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ANO5	Q75V66	913 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	LRR1	Q96L50	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.07	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HS3ST1	O14792	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	EXTL3	O43909	919 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CIDEA	O60543	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KRT5	P13647	590 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CSF2RA	P15509	400 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	GNB3	P16520	340 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	HOXC8	P31273	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CCT5	P48643	541 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	OLIG2	Q13516	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.06	□□□□□ -1.76
COPS5-208	ENST00000519057	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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