RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 PELI3Q8N2H9 469 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NAT14Q8WUY8 206 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ASB2Q96Q27 587 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 P2RY12Q9H244 342 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ASB8Q9H765 288 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TDP1Q9NUW8 608 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.61■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 CLCN7P51798 805 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CCNG1P51959 295 aa16.59■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 BPIP17213 487 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ITGALP20701 1170 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 IRS1P35568 1242 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CLCQ05315 142 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SLC34A1Q06495 639 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HERC3Q15034 1050 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HPS6Q86YV9 775 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 DSELQ8IZU8 1212 aa16.59■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
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TOM1-216ENST00000492723 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT1A6P19224 532 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT1A1P22309 533 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT1A4P22310 534 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT1A3P35503 534 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT1A5P35504 534 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ANKS6Q68DC2 871 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SNX20Q7Z614 316 aa16.58■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 GPSM1Q86YR5 675 aa16.58■□□□□ 0.25
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